1 Hepatology|中山大學附屬第一醫院匡銘教授團隊揭示肝細胞癌射頻消融后復發潛在機制 原文題目:Eliminating METTL1-mediated accumulation of PMN-MDSCs prevents hepatocellular carcinoma recurrence after radiofrequency ablation 發表期刊:Hepatology 閱讀量:3634 對于多重免疫熒光染色的樣本,文中均使用TissueFAXS多光譜成像系統(TissueGnostics, Austria)進行掃描。對成像結果使用了StrataQuest分析軟件在單細胞水平上進行分析。在分析方法上,通過StrataQuest分析軟件可以得到不同顏色通道的灰度圖,在DAPI通道圖像上應用核識別算法對單個細胞進行識別和圈定。然后,通過平均灰度值計算每個細胞每種不同Marker的表達量。繪制強度直方圖和散點圖,通過手動設置cut-off以及圖像回溯功能得到每個Marker的陽性細胞數和陰性細胞數。 傳統通過軟件算法進行單細胞分析,只能進行原始的細胞核簡單識別,細胞質、細胞膜等結構依賴于通過算法擴大細胞核輪廓,無法完成真實的細胞質形態學識別。TissueFAXS Cytometry技術不但可以針對每個熒光通道的細胞質形態進行圈選,還可以結合細胞核輪廓,實現單細胞的核/質/膜等亞細胞結構真實染色強度和形態的分析。 通過免疫組化和多重免疫熒光(mIF)染色,發現在RFA后復發的HCC中,METTL1表達增強,伴有CD11b+CD15+ PMN-MDSCs的增加和CD8+ T細胞的減少。 2 山東大學基礎醫學院馬春紅教授團隊全新空間角度描繪Tim-3腫瘤免疫治療策略新思路 原文題目:Spatial distribution and functional analysis define the action pathway of Tim-3/Tim-3 ligands in tumor development 發表期刊:Molecular Therapy 閱讀量:1489 實驗部分采用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra全景多光譜組織掃描定量分析系統肝細胞癌(HCC)組織芯片樣本(TMA)進行多色熒光圖像采集,并且通過StrataQuest定量分析軟件對腫瘤組織和癌旁組織中不同類型的細胞數量比例,陽性率以及空間位置分布進行準確定量。 TMA 1(93例癌組織和87例癌旁組織,CD4,CD8,CD56,Tim-3) TMA 2(100例癌組織和97例癌旁組織,CD3,CD4,HepPar-1,Tim-3,Tim-3 Fc) 3 JCI封面文章| 中山大學北京大學聯合揭示口腔腫瘤免疫逃逸機制和新的治療靶點 原文題目:TDO2+ myofibroblasts mediate immune suppression in malignant transformation of squamous cell carcinoma 發表期刊:Journal of Clinical Investigation 閱讀量:1262 使用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra全景多光譜組織掃描定量分析系統獲取圖像。獲取到圖像利用StrataQuest軟件進行定量分析。應用TissueFAXS Cytometry技術,研究者通過免疫熒光證實TDO2僅表達于癌組織的a-SMA+肌成纖維細胞中,并且通過多色免疫組化(mIHC)染色證明: 1. TDO2+肌成纖維細胞(TDO2+α-SMA+)、TDO2-肌成纖維細胞(TDO2-α-SMA+)和癌細胞(Pan-CK+)及癌巢近端/遠端的空間定位關系。 2. CD4+和CD8+T細胞在TDO2+和TDO2-肌成纖維細胞周圍分布的關系。 3. TDO2+和TDO2-肌成纖維細胞(半徑<50μm)周圍Foxp3+CD4+T細胞的空間分布比例關系。 4. TDO2+肌成纖維細胞周圍PD-1+TIM-3+CD8+T細胞的空間分布關系。 5. TDO2+或TDO2-肌成纖維細胞在癌巢邊界近端和遠端的空間分布。 6.未治療組與TDO2i組小鼠癌巢邊界近端100um區域內,Foxp3+CD4+1043T細胞的空間分布及比例。 7. 未處理組和TDO2i組之間,TIM-3+CD8+T細胞和GZMB+CD8+T細胞在癌巢邊界近端100um區域內的空間分布及比例。 4 STTT重磅| 南京大學團隊揭示腫瘤“善變”的巨噬細胞在塑造微環境的發生機制 原文題目:Intervening pyruvate carboxylase stunts tumor growth by strengthening anti-tumor actions of tumor-associated macrophages 發表期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy 閱讀量:1145 首先,作者通過免疫熒光技術分析了69塊黑色素瘤和14塊正常組織(TMA樣本)PCB的表達情況,利用TissueGnostic公司TissueFAXS掃描系統對TMA樣本進行圖像采集,并使用TissueGnostic公司專業級組織原位定量分析系統StrataQuest對PCB的表達準確定量,結果顯示在黑色素瘤患者中TAMs中的PCB表達量顯著下降。 隨后,考慮到缺氧是實體腫瘤的一個關鍵特征,同樣,通過通過免疫熒光技術,使用TissueFAXS掃描系統對小鼠腫瘤切片進行掃描成像,StrataQuest定量分析發現位于HIF-α高表達區域的TAMs的PCB豐度低于位于HIF-α低表達區域的TAMs。 機制方面,文章表明PCB能夠促進肌球蛋白MYH6與F-actin的結合而重塑巨噬細胞骨架,驅動TAMs對腫瘤細胞的吞噬。通過構建遞氧/激活PCB的雙功能納米顆粒FDC-GTA@HSA,同時改善乏氧并激活PCB,抑制細胞IRF1-PD-L1軸,增強了微環境中CD8+ T細胞的浸潤,逆轉微環境免疫抑制狀態。此研究結果不僅發現PCB 的非經典生物學功能與調控新機制,而且構建了“靶向干預TAMs極化”的專利技術,可用于進一步免疫治療新策略構建。 5 Nature Communications| 華中科技大學提出改善光熱療法在腫瘤治療中的新策略 原文題目:Reversing insufficient photothermal therapy-induced tumor relapse and metastasis by regulating cancer-associated fibroblasts 發表期刊:Nature Communications 閱讀量:1140 文中使用了StrataQuest分析軟件(TissueGnostics)進行數據分析,結果通過散點圖或直方圖展示,并可以通過回溯功能驗證結果的準確性。StrataQuest分析軟件不僅可以在單細胞水平上定量分析腫瘤不同標記物的陽性水平,也可以在空間范圍內分析不同標記陽性細胞間的距離關系,揭示不同細胞在組織內的分布關系。 6 南京大學沈萍萍教授團隊揭示PPARγ翻譯后修飾調控細胞代謝重編程的新機制 原文題目:Blockage of PPARγ T166 phosphorylation enhances the inducibility of beige adipocytes and improves metabolic dysfunctions 發表期刊:Cell Death & Differentiation 閱讀量:908 在本研究中,為了能夠系統地評估PPARγ T166磷酸化調控的脂肪組織米色化的效能,研究團隊運用了TissueGnostic公司的TissueFAXS掃描系統對小鼠整塊皮下脂肪組織的最大縱向橫截面進行了全景定量分析與精確地數據采集,全面獲取了脂肪細胞大小、脂滴尺寸、脂滴形態等信息。 并通過TissueGnostic公司專業級組織原位定量分析系統StrataQuest對獲取到的數據信息進行進一步的統計分析,發現PPARγ T166磷酸化可阻礙脂肪細胞內脂滴多室化,促進1000-1000μm2的大脂滴的形成,而干預PPARγ T166磷酸化可逆轉此過程。 此外,通過運用該系統,研究團隊還對PPARγ T166磷酸化位點的點突變小鼠脂肪細胞內脂質含量進行了評估,并發現PPARγ T166磷酸化可介導脂肪細胞內的脂質堆積。 7 Nature Communications| 蛋白磷酸酶2A(PP2A)或將成為腫瘤生物標志物“新寵” 原文題目:Protein phosphatase 2A inactivation induces microsatellite instability, neoantigen production and immune response 發表期刊:Nature Communication 閱讀量:891 作者利用TissueGnostic公司的TissueFAXS掃描成像系統分別對類器官培養樣本,小鼠原發結腸癌組織以及人類結腸癌組織三種不同的免疫組化樣本進行成像,發現無論是類器官培養樣本還是小鼠原發結腸癌組織樣本,PP2A的失活都導致錯配修復蛋白MLH1蛋白水平降低。 在對人類MSS和MSI型結腸癌免疫組化樣本分析時,再次利用TissueGnostics公司單細胞定量分析軟件HistoQuest對PP2A內源性抑制物,CIP2A和SET以及PP2A本身的蛋白表達水平進行了準確的定量,并以蛋白的陽性率的數值對表達水平進行了分級,HistoQuest為組織原位單細胞的定量數據提供了強有力的支持。 8 Science子刊|TissueFAXS Cytometery技術&新型細胞因子療法為腫瘤免疫治療帶來希望 原文題目:Lack of CD8+ T cell effector differentiation during priming mediates checkpoint blockade resistance in non–small cell lung cancer 發表期刊:Science Immunology 閱讀量:722 實驗部分采用TissueGnostics公司TissueFAXS 全景組織流式定量分析系統對側腹部腫瘤組織樣本和肺部腫瘤組織樣本進行全景圖像采集,并且通過TissueQuest定量分析軟件不同腫瘤中腫瘤生長面積與組織占比進行準確定量,發現肺部腫瘤組織樣本能夠抵抗ICB治療,而側腹部腫瘤組織樣本中腫瘤明顯減小。 同時,通過對腫瘤區域的腫瘤浸潤淋巴細胞 (TIL) 進行免疫熒光染色,準確定量TILs密度發現側腹部腫瘤組織樣本和肺部腫瘤組織樣本(CD8,Pan-Cytokeratin,PI)中均存在TILs,但是在ICB治療后,側腹部腫瘤組織中TILs數量明顯增加。 9 中山大學附屬第三醫院高壓氧聯合抗腫瘤藥物增強PD-1抗體對肝癌細胞的作用 原文題目:Hyperbaric oxygen facilitates teniposide-induced cGAS-STING activation to enhance the antitumor efficacy of PD-1 antibody in HCC 發表期刊:Journal for ImmunoTherapy Cancer 閱讀量:680 為了最大限度地激活肝細胞癌,中山大學附屬第三醫院肝臟外科暨肝臟移植中心楊揚教授團隊結合了替尼泊苷和HBO療法。安全地刺激了免疫原性、T細胞炎癥的肝癌TME,導致腫瘤對抗PD-1免疫療法進一步增敏。并且嘗試通過有效的腫瘤復氧增強DNA激活的STING信號來提高肝癌患者對PD-1抗體的應答率。這些發現都可能為晚期肝癌的治療提供有效的方法。 使用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra SL高通量全景多光譜組織掃描定量分析系統獲取多色免疫組化肝癌樣本(P-IRF3,CD11c,CD3,CD8和DAPI)圖像。 10 TissueFAXS Cytometry技術再助力MIT團隊在新冠肺炎T細胞亞群研究的新發現 原文題目:Temporal changes in T cell subsets and expansion of cytotoxic CD4+ T cells in the lungs in severe COVID-19 發表期刊:Clinical Immunology 閱讀量:570 首先作者對重癥COVID-19患者肺部的CD8+ T細胞浸潤進行多色熒光染色,利用TissueGnostics公司的TissueFAXS掃描系統對組織切片進行拍攝,并同時利用TissueQuest定量分析系統對不同患者樣本的免疫細胞數量及占比進行精確定量。 隨后,作者對引流淋巴結同樣進行切片染色分析,使用TissueQuest定量發現在晚期COVID-19患者體內表現出CD4+ T細胞淋巴細胞減少和CD4+ CTL表型細胞增加。大多數CD4+ T細胞淋巴細胞減少可能與淋巴結中CXCR5 + CD4+ TFH細胞的丟失有關。 最后,基于CD4 + CTLs細胞亞群的增加,進一步對HLA-DR以及cCasp3等表達進行分析,結果顯示CD4 + CTLs細胞在晚期內流和病毒的清除可能與感染細胞凋亡死亡的增加有關。更有意思的是,巨噬細胞浸潤作為COVID-19的一個特征,同樣在晚期有很高比例的浸潤。
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